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諾賽基因可以提供專業(yè),個性化定制的基因組服務,我們擁有先進的儀器設備以及一系列專業(yè)的基因組解決方案,可以確保您得到快速準確的服務以及專業(yè)全面的檢測報告。

技術(shù)服務

一、TA克隆

項目介紹


TA克隆技術(shù)(TA cloning)利用Taq聚合酶具有末端轉(zhuǎn)移酶活性,可在PCR產(chǎn)物的3'端加上一個非模板依賴堿基“A”。T載體是一種高效克隆PCR產(chǎn)物的專用開環(huán)載體。因其3'端帶有一個突出的“T”尾,能高效地與帶“A”尾的PCR產(chǎn)物連接,極大地提高了克隆的效率。TA克隆是目前克隆PCR產(chǎn)物最簡便、快捷的方法。

實驗流程

送樣要求


(1)TA克隆項目的樣本類型一般是以PCR產(chǎn)物居多,或是特異性酶切產(chǎn)物片段,用于做TA克隆的樣本建議長度≤3K。

(2)需要提供克隆片段的相關信息,包括名稱、大小、樣品是否帶有“A”尾以及PCR產(chǎn)物是否已純化。已純化的PCR產(chǎn)物請確保使用的溶劑為滅菌的雙蒸水。

(3)PCR已純化樣品,要求濃度≥20ng/μl,體積≥20μl;PCR未純化樣品,要求濃度≥50ng/μl,體積≥25μl。所需DNA的總量會隨片段大小的不同而有所變化。樣品定量檢測結(jié)果以實際為準。

(4)請務必在訂單上注明 PCR所用引物序列,便于克隆結(jié)果的核對分析。

提供的結(jié)果


(1)測序原始圖譜和序列。

(2)要求測通的樣品可以提供拼接序列。

備注:

(1)鑒定結(jié)果以測序序列(或拼接序列)、質(zhì)粒返樣形式呈現(xiàn)。

(2)當克隆結(jié)果中包含客戶提供的單向部分引物序列,即視實驗成功。

(3)若序列中包含高GC、Poly等特殊或復雜結(jié)構(gòu)導致測序中斷,屬于非實驗因素,實驗也屬于成功檢測。

(4)項目完成客戶若無要求返還菌液或質(zhì)粒等,則默認保存一個月后由我司滅菌消毀。
技術(shù)原理

(1)E-mail:測序部dnaseq@vip.163.com。

(2)電話訂購:010-67873039/4478,010-67868644;李經(jīng)理:13522520637;王經(jīng)理:15210696931

(3)QQ咨詢:——————。

(4)相關資料:TA克隆測序訂購表。

二、菌種鑒定

項目介紹


菌種鑒定一般是指提取樣品基因組DNA,然后PCR擴增相對應的片段,經(jīng)上機測序之后,在數(shù)據(jù)庫GeneBank比對序列即可。菌種鑒定項目一般采用核酸序列分析法分析細菌16S rDNA/16S-23S rDNA區(qū)間序列、酵母18S rDNA/26S rDNA(D1/D2)序列及絲狀真菌的18S rDNA/ ITS1-5.8S-ITS2序列,提供科學的鑒定結(jié)果。一般序列相似度在98%以上,可以認為是同一個種細菌(DNA序列僅作為一個參考指標)。


實驗流程


送樣要求


菌種鑒定項目的樣本類型一般是沉菌/單菌落菌液/平板(以單菌落/平板為宜)。

送樣要求:

1)建議務必仔細閱讀、填寫和提交《微生物菌種鑒定評價協(xié)議書》,未填寫協(xié)議書的樣品不予受理。(此項可以參考CICC菌種鑒定與評價服務項目)。

2)委托鑒定菌株應為非致病菌,且來源明確;若屬于中華人民共和國衛(wèi)生部制定的《人間傳染的病原微生物名錄》之內(nèi)菌株,將停止鑒定實驗。

3)需要提供送檢樣本的相關信息,包括名稱、培養(yǎng)基相關信息、菌落平板生長時間。且平板樣本需要出現(xiàn)單菌落,建議使用分區(qū)劃線法,避免平板上菌落過于密集生長。

4)請務必在訂單上注明菌種鑒定詳細需求,一般默認是鑒定到。

5)項目完成兩周后,若客戶無要求返還平板樣品等,則默認滅菌處理。


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鑒定結(jié)果一般是以測序序列(或拼接序列)、菌種鑒定報告形式呈現(xiàn),包括:
(1)菌種鑒定報告(文檔)
(2)測序原始圖譜和序列
(3)樣品拼接序列


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(2)電話訂購:010-67873039/4478,010-67868644;李經(jīng)理:13522520637;王經(jīng)理:15210696931

(3)QQ咨詢:——————。

(4)相關資料:菌種鑒定訂購單。



三、SNP位點(單核苷酸多態(tài)性分析)檢測

項目介紹


SNP(single nucleotide polymorphism),即單核苷酸多態(tài)性或單堿基多型性,主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性,是一種較為常見的人類可遺傳的變異。SNP以單個堿基的顛倒、轉(zhuǎn)換、插入和缺失等形式存在。SNP檢測服務是檢測染色體基因組中單個核苷酸的突變而引起的DNA序列的多態(tài)性的技術(shù)服務。作為第三代分子遺傳標記,與其分子標記相比,SNP分辨率最高也最為豐富,覆蓋基因組范圍大,遺傳上比較穩(wěn)定。




??方法儀器平臺單個反應點數(shù)應用領域
TaqMan探針法熒光定量PCR1-2大量樣本且檢測位點少
擴增測序方法ABI測序儀1-5樣本最少且位點數(shù)少、位點驗證發(fā)現(xiàn)特定區(qū)域內(nèi)的SNP
SNaPshot法ABI測序儀1-15中等樣本數(shù)且檢測位點數(shù)中等通量
ARMS-PCR 法ABI測序儀1-20有長期常規(guī)需求或特大量樣本.如臨床需求、大田作物檢測等。
KASP方法7900PCR儀數(shù)個至數(shù)十技術(shù)成熟,通量越高優(yōu)勢越明顯
MassARRAY 法Sequenom質(zhì)譜儀1-30大量樣本且中等通量檢測、不涉及熒光標記的檢測
芯片法SNP芯片數(shù)十萬人源樣本高通量位點檢測
目標區(qū)域測序/ 重測序高通量測序平臺數(shù)萬至數(shù)百萬全基因組檢測、特定或復雜需求發(fā)現(xiàn)新的SNP
高通量擴增子測序高通量測序平臺數(shù)十至數(shù)萬個性化定制中高通量panel

送樣要求


SNP位點檢測項目的樣本類型一般是核酸DNA。

1)需要提供樣本的相關信息,包括樣本名稱及數(shù)量、核酸類型、檢測位點數(shù)量等。

2)在訂單上注明樣本的檢測需求,根據(jù)不同的方法進行實驗設計。

3)組織樣品送的核酸樣本300mg;血液樣本1ml;游離DNA1ng;基因組類樣品要求濃度50ng/μl,體積≥20μl。

4)項目完成兩周后,若客戶無要求返還樣品等,則默認為樣品將被處理。


提供的結(jié)果

檢測結(jié)果一般是以測序序列(或拼接序列)和文字表格形式呈現(xiàn)。

可以提供的結(jié)果如下:

(1)設計、合成的SNP位點引物。

(2)測序原始圖譜和序列。


訂購信息


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四、實時熒光定量PCR

項目介紹



實時熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR)是通過對PCR擴增反應中每一個循環(huán)產(chǎn)物熒光信號的實時監(jiān)測從而實現(xiàn)對起始模板定量及定性的分析。主要分為熒光染料法(SYBR Green I)和熒光探針法(Taqman 技術(shù))。

實驗流程


SYBR GreenI是熒光定量PCR常用的DNA結(jié)合染料之一,可以與雙鏈DNA非特異性結(jié)合。SYBR Green I在游離狀態(tài)下會發(fā)出微弱的熒光,一旦與雙鏈DNA結(jié)合,其熒光值會指數(shù)級增加。所以,一個PCR循環(huán)反應發(fā)出的全部熒光信號與雙鏈DNA量呈比例,隨著PCR擴增產(chǎn)物的增加而增加,其熒光信號強度與PCR產(chǎn)物的數(shù)量呈正相關。

熒光探針法(Taqman 技術(shù))是指PCR擴增時,加入一對引物的同時再加入一個特異性的熒光探針。該探針為一條寡核苷酸,兩端分別標記一個熒光報告基團和一個熒光淬滅基團。探針完整時,報告基團發(fā)出的熒光信號被淬滅基團吸收,PCR 儀檢測不到熒光信號;PCR擴增時(延伸階段),Taq 酶的5'-3'切酶活性將探針酶切,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)接收到熒光信號。即每擴增一條DNA鏈,即形成一個熒光分子,實現(xiàn)了熒光信號的累積與 PCR 產(chǎn)物形成同步。

送樣要求




實時熒光定量PCR檢測項目的樣本類型一般是核酸。

1)提供樣本、RS號或NCBI可查詢目的基因的序列號。

2)提供核酸樣本要求:RNA要求濃度≥20ng/μl,體積≥15μl,OD值接近2.0左右,電泳18s、28s條帶清晰;DNA濃度≥20ng/μl,體積≥25μl,A260/280比值在1.8-2.0。

3)提供的樣本需要標記詳細的編號、名稱、檢測位點名稱及數(shù)量等。


提供的結(jié)果


檢測結(jié)果一般是以EXCEL原始擴增數(shù)據(jù)和實驗結(jié)果報告形式呈現(xiàn)。

內(nèi)容包括:

(1)設計、合成的檢測位點引物;

(2)原始擴增數(shù)據(jù)EXCEL或曲線圖;

(3)數(shù)據(jù)分析結(jié)果;

4)檢測報告。



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